De paleoecologie houdt zich bezig met de reconstructie van de natuurlijke omgeving op een bepaalde locatie en veranderingen daarvan door de tijd. Dit kunnen veranderingen zijn onder invloed van het klimaat, maar ook veranderingen die, al dan niet opzettelijk, zijn teweeggebracht door de mens. ArcheoSpecialisten reconstrueert deze processen onder andere door middel van pollenonderzoek (fossiel stuifmeel) en onderzoek van macroresten (zaden en vruchten). Daarnaast worden monsters genomen (of kan advies daartoe worden gegeven) voor 14C dateringen en kunnen hout- en houtskoolresten worden gedetermineerd.
Paleoecologisch onderzoek levert hiermee een belangrijke bijdrage aan de landschappelijke reconstructie van een vindplaats en er wordt dan ook nauw samengewerkt met de fysisch geografen. Hierdoor kunnen de lanschappelijke onderzoeksvragen vanuit verschillende hoeken worden benaderd en is een goede onderlinge afstemming mogelijk.
